Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms