Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms