Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tgfbr3lD3YZZ2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tgfbr3lD3YZZ2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tgfbr3lD3YZZ2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tgfbr3lD3YZZ2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tgfbr3lD3YZZ2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tgfbr3lD3YZZ2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tgfbr3lD3YZZ2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tgfbr3lD3YZZ2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tgfbr3lD3YZZ2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tgfbr3lD3YZZ2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tgfbr3lD3YZZ2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms