Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms