Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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