Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms