Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms