Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms