Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms