Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf518aB2RRF6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms