Protein–RNA interactions for Protein: B1AXB9

Gm4907, Predicted gene 4907, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4907B1AXB9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4907B1AXB9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms