Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Trabd2bB1ATG9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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