Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms