Protein–RNA interactions for Protein: B1AQP7

Apol7b, Apolipoprotein L 7b, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7bB1AQP7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Apol7bB1AQP7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Apol7bB1AQP7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Apol7bB1AQP7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Apol7bB1AQP7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apol7bB1AQP7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms