Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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