Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl41A2AUC9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms