Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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