Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttll9A2APC3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms