Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms