Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms