Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd1A2AKB4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
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