Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Prdm16A2A935 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Prdm16A2A935 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Prdm16A2A935 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Prdm16A2A935 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Prdm16A2A935 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Prdm16A2A935 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Prdm16A2A935 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Prdm16A2A935 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Prdm16A2A935 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm16A2A935 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms