Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pramef6A2A8M8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms