Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm27029A2A4P4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm27029A2A4P4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm27029A2A4P4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm27029A2A4P4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm27029A2A4P4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm27029A2A4P4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms