Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc194A0A140LIT1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc194A0A140LIT1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc194A0A140LIT1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc194A0A140LIT1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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