Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Hdac5Q9Z2V6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Hdac5Q9Z2V6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Hdac5Q9Z2V6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Hdac5Q9Z2V6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Hdac5Q9Z2V6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Hdac5Q9Z2V6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Hdac5Q9Z2V6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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