Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Hdac6Q9Z2V5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Hdac6Q9Z2V5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Hdac6Q9Z2V5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Hdac6Q9Z2V5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Hdac6Q9Z2V5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Hdac6Q9Z2V5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Hdac6Q9Z2V5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Hdac6Q9Z2V5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Hdac6Q9Z2V5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Hdac6Q9Z2V5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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