Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Robo3Q9Z2I4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms