Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms