Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Setbp1Q9Z180 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Setbp1Q9Z180 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms