Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nme3Q9WV85 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms