Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms