Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Trim10Q9WUH5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms