Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms