Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn4Q9WU22 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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