Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp18Q9WTV6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Usp18Q9WTV6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp18Q9WTV6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp18Q9WTV6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp18Q9WTV6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp18Q9WTV6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp18Q9WTV6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp18Q9WTV6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp18Q9WTV6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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