Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PplQ9R269 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PplQ9R269 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PplQ9R269 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PplQ9R269 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms