Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubd1Q9R1K7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubd1Q9R1K7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubd1Q9R1K7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubd1Q9R1K7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubd1Q9R1K7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubd1Q9R1K7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubd1Q9R1K7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubd1Q9R1K7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubd1Q9R1K7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubd1Q9R1K7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms