Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms