Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms