Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms