Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms