Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnf4Q9QZS2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnf4Q9QZS2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf4Q9QZS2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf4Q9QZS2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf4Q9QZS2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rnf4Q9QZS2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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