Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Col4a4Q9QZR9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Col4a4Q9QZR9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Col4a4Q9QZR9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Col4a4Q9QZR9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col4a4Q9QZR9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col4a4Q9QZR9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col4a4Q9QZR9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col4a4Q9QZR9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col4a4Q9QZR9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Col4a4Q9QZR9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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