Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms