Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms