Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc1Q9QZF2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms