Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms