Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Trpc3Q9QZC1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Trpc3Q9QZC1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Trpc3Q9QZC1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Trpc3Q9QZC1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Trpc3Q9QZC1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Trpc3Q9QZC1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Trpc3Q9QZC1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Trpc3Q9QZC1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Trpc3Q9QZC1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Trpc3Q9QZC1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Trpc3Q9QZC1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Trpc3Q9QZC1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms