Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms